Сюжет
1944 год. Польша. В Варшавском гетто еврейский мальчик по имени Эрик Леншерр от безысходности и отчаяния силой мысли сгибает мощные металлические ворота.
Не очень далёкое будущее. Девушка-подросток Мари во время своего первого в жизни поцелуя прикоснулась к парню, и тот вдруг свалился на пол в страшных конвульсиях. А через три недели, не выходя из комы, парень скончался в больнице…
Это только два примера генетических мутаций, названных «Генами-Икс», проявляющихся только в период полового созревания, но эти феноменальные случаи стали основой последовавших за этим событий, которые, в конце концов, изменили сознание людей и социальную картину мира.
Учёные давно уже отметили возросшее в последние годы число мутаций, в результате которых стали появляться люди с экстраординарными способностями. Известным учёным, а также мутантом-телепатом профессором Чарльзом Ксавьером была организована школа для одарённых детей, под прикрытием которой функционировала группа мутантов, состоящая из учеников, только учащихся контролировать свои необычные способности и их учителей — уже опытных мутантов. В то же самое время американский сенат с подачи сенатора Роберта Келли принял закон о начале регистрации мутантов и их способностей, с целью выявления особо опасных представителей. Феномен мутации даже был внесён на рассмотрение очередной сессии ООН.
На севере провинции Альберта (Канада) Мари, сбежавшая из родного дома, и страшащаяся своих новых способностей, надеется найти наиболее безлюдное место на Земле, чтобы никому и никогда более не причинять вреда. На её руках обязательные рукавицы, так как организм девушки причиняет смертельные муки всему живому, к чему прикасается. Остановившись перекусить в местной забегаловке, Мари, для конспирации взявшая себе прозвище «Роуг», случайно встречается с таким же мутантом-отшельником, как сама — Логаном, по прозвищу «Росомаха». Его способности заключаются в том, что он имеет невероятные возможности к регенерации, да ещё к тому же при его желании из кистей его рук извлекаются по три лезвия из непробиваемого металла адамантия. Росомаха и Роуг попадают в неприятность — их пытается захватить мутант по способностям, напоминающих способности Росомахи — Саблезубый. Неизвестно, чем бы закончилась эта стычка, но Росомаху выручает оказавшаяся неподалёку группа мутантов профессора Икс.
Так Росомаха и Роуг попадают в необычный дом-школу Чарльза Ксавьера, расположенную в уединении в штате Нью-Йорк.
Здесь молодые мутанты оказываются в мире себе подобных, самые одарённые из которых помогают профессору Икс не только заниматься поисками новых детей-мутантов, но и успешно противостоять Магнето — тому самому еврейскому мальчику из Варшавского гетто, который спустя многие годы тренировок и изучения физических свойств металлов, полностью раскрыл свой дар. Уже пожилой Эрик Леншерр считает, что война людей с мутантами неизбежна, ведь люди это низшее звено в цепи эволюции, которое мешает свободе новых людей — мутантов. Он старается всеми способами ускорить эту войну и потому противостоит всем попыткам Чарльза Ксавьера уничтожить страх и настороженность обыкновенных людей по отношению к мутантам. Магнето собрал команду единомышленников. Он не верит, что люди и мутанты когда-либо смогут мирно сосуществовать, и разработал план, как раз и навсегда решить проблему этого противостояния.
Магнето выкрал сенатора Келли — самого ярого активиста за ограничение свободы мутантов в резервациях. На нём он испытал своё изобретение — машину для превращения людей в мутантов. Сенатор становится эластичным водянистым существом, успевает раскаяться в своей прежней позиции, но через несколько дней умирает. В этом заключается недостаток машины, о котором не знает Эрик. Конечной же целью Магнето является использование своей машины во время саммита ООН в Нью-Йорке около Статуи Свободы, на котором будут присутствовать главы всех крупных держав мира. Злой гений надеялся таким образом превратить крупных политиков в мутантов и таким образом принудить их легализовать новую человеческую расу. И как итог — взять власть над миром в свои руки.
Но планам Магнето, захватившего Мари, в качестве источника энергии для своей чудо-машины (используя её умение перенимать способности других мутантов), помешали его вечный противник Чарльз Ксавьер и его лучшие ученики: управляющая погодой Шторм, прячущий под специальными очками свои смертоносные глаза Циклоп, телепат и телекинетик Джина Грей, а также Росомаха, присоединившийся для спасения ставшей ему подругой Роуг. Они преодолевают сопротивление трёх помощников Магнето: звероподобного Саблезубого, Мистик — женщины, способной менять своё обличье и Жабы.
Люди Икс, пусть с трудом, но останавливают Магнето и спасают человечество от насильственного распространения мутации. Мистик находят в обличье охранника, и мы узнаём, что она жива.
Следующие кадры переносят нас в школу, взгляд сенатора Келли (в интервью программы) — жёлтые хищные глаза Мистик, занявшей его место…
Последним кадром фильма становится встреча Профессора Икс и Магнето в «пластмассовой» тюрьме. Магнето предупреждает Профессора, что эта тюрьма не сможет его долго сдерживать, и когда он выберется, он намерен продолжить своё дело. На что Профессор отвечает, что всегда будет рядом со своим другом, что даёт концовке некую двусмысленность.
