Сюжет
На борту корабля «Сулако» обнаруживается Лицехват, который при попытке взломать криокапсулу ранит себя, и его кровь из кислоты вызывает пожар. Капсулы с находящимися в гиперсне лейтенантом Эллен Рипли, Ребеккой Джорден, Дуэйном Хиксом и андроидом Бишопом погружаются в спасательную шлюпку. При посадке медицинское сканирование капсул показывает, что у одного из спящих на лице сидит Лицехват. Отстыковавшись, шлюпка падает в океан на планете Фиорина-161 — тюрьму строгого режима, где содержатся преступники исключительно мужского пола. Тюрьма является собственностью «Вэйланд-Ютани» — когда-то она была литейным заводом, который теперь закрыт. Выживает только Рипли — Ребекка захлёбывается, Хикса протыкает опорная балка, а Бишоп, повреждённый в финале «Чужие», полностью выведен из строя. Когда шлюпку вытаскивают из воды, к тюремной собаке, которая стоит у входа в неё, приближается лицехват. Тюремный врач Клеменс выхаживает Рипли, а надзиратель тюрьмы Гарольд Эндрюс запрашивает у «Вэйланд-Ютани» эвакуацию лейтенанта. Присутствие Рипли на Фиорине очень пагубно — здесь отбывают срок отморозки, страдающие синдромом Джекобса. Осмотрев шлюпку, Рипли замечает следы кислотной крови Чужих и просит сделать вскрытие тела Ребекки, которое ничего не обнаруживает. Она ничего не рассказывает о том, с чем столкнулась в прошлом.
Тела Ребекки и Хикса кремируют в плавильном цеху. В то же время тюремная собака, гуляющая где-то в отдалённом помещении, бьётся в судорогах и из неё вылупляется Чужой. Скоро работающий в вентиляционной шахте заключённый Мёрфи получает плевок кислотой в лицо и падает на вентилятор. Между тем следы кислотной крови Чужого не дают Рипли покоя, и она находит на местной свалке выброшенные туда останки Бишопа и подключает его к чёрному ящику спасательной шлюпки. Рипли узнаёт, что на борту шлюпки и «Сулако» был Чужой. Когда она спрашивает Бишопа, знает ли об этом «Вэйланд-Ютани», тот отвечает, что они всегда знали об этом — все данные с «Сулако» переправлялись туда. Троих заключённых отправляют в шахту, где на них нападает Чужой. В живых остаётся только заключённый Голик, который от увиденного теряет рассудок, из-за чего считают, что он убил двух других заключённых. Рипли слышит, как Голик рассказывает про Чужого, и решает поговорить с Эндрюсом о монстре, но тот ей не верит и приказывает посадить под карантин в лазарет. Рипли узнаёт, что в тюрьме совершенно нет никакого оружия. В лазарете она видит, как Клеменса убивает Чужой, который затем подходит вплотную к Рипли, но, по неизвестной причине, не причиняет ей никакого вреда и уходит через воздуховод. Она бежит в столовую, где Эндрюс делает отчёт по предшествующим событиям, и пытается сообщить о Чужом, но тут из воздуховода появляется Чужой и утаскивает Эндрюса.
Заключённые решают организоваться и заманить монстра в бункер для хранения ядерных отходов. Они разливают горючую смесь по коридорам тюрьмы, чтобы поджечь её, вытравить Чужого из вентиляции и загнать его в бункер. Затея не имеет успеха, так как Чужой, убив одного заключённого, сам невольно устраивает пожар, из-за чего гибнут несколько заключённых. В какой-то момент Рипли начинает мучить недомогание, кроме того, она понимает, что Чужой неспроста не убил её в момент их встречи. Она возвращается к шлюпке, проводит рентгеновское сканирование своего организма и понимает, что внутри неё развивается матка Чужого. Тогда Рипли просит религиозного заключённого Диллона убить её, но тот отказывается. Он требует, чтобы сначала Рипли помогла убить Чужого, а потом он займётся ею. Выясняется, что представители «Вэйланд-Ютани» уже на подлёте и скоро приземлятся. Рипли догадывается, что компания знает, о том, что она носит эмбрион матки, и что за ней придут только для того, чтобы завладеть Чужим. Рипли решает избавиться от монстра до их прилёта. Принимается решение попытаться загнать Чужого в форму для отливки в плавильном цехе, после чего пустить в неё расплавленный свинец. Чтобы получить поддержку со стороны выживших заключённых, Рипли говорит что компания не пощадит никого, чтобы завладеть Чужим, рассказывая про экипаж «Ностромо» и отряд морпехов вместе с колонистами «Надежды Хадли».
После того, как Чужой появляется, заключённые пытаются заманить его в форму. В результате это им удаётся, однако в живых остаются всего четверо: заключённый Морзе, заместитель начальника Эрон и Диллон с Рипли. Морзе пробирается к панели управления, а Рипли с Диллоном остаются в форме один на один с Чужим. Диллон понимает, что кто-то из них должен остаться внутри, чтобы отвлечь монстра, и принимает решение пожертвовать собой. Рипли вылезает наверх, а Чужой набрасывается на Диллона. В этот момент Морзе нажимает на спуск, и несколько тонн расплавленного свинца выливаются на Чужого, но монстр, раскалённый, вырывается из расплава. Морзе кричит Рипли, чтобы она включила охлаждающую водяную форсунку. Форсунка разбрызгивает воду на Чужого, после чего тот от резкого перепада температуры взрывается. В этот момент Эрон приводит в цех представителей компании. Их лидер является точной копией андроида Бишопа, но утверждает, что он всего лишь создатель этого робота. Он обещает Рипли, что они извлекут эмбрион матки из её тела и уничтожат, а её саму спасут. Рипли не верит, и они вместе с Морзе отступают к краю формы. В этот момент один из прибывших солдат стреляет в Морзе, ранив его в ногу. Эрон наносит псевдо-Бишопу удар по голове, за что его расстреливают. Рипли отходит к краю платформы и сознательно падает в расплавленный металл. Во время падения из её груди вылупляется матка, которую умирающая Рипли прижимает к себе. Представители компании покидают опустевшую тюрьму, забирая с собой Морзе. После их отлёта в спасательной шлюпке с «Сулако» проигрывается сообщение Рипли, которое она записала в финале «Чужого». Фильм завершается рапортом о том, что тюрьма на Фиорине закрыта, оборудование будет продано на металлолом.
